UNU Purwokerto memiliki nilai-nilai yang diperjuangkan dalam penyelenggaraan tridharma perguruan tinggi sesuai dengan visi dan misinya. Nilai-nilai unggul yang ada di dalam UNU Purwokerto adalah landasan Aswaja An-Nahdliyah di dalam penyelenggaraan Tridharma Perguruan Tinggi, Civita Akademika yang memiliki jiwa wirausaha, berwawasan global serta mampu mengembangkan ilmu pengetahuan dan teknologi untuk kemaslahatan umat.
